Die Besetzung besteht aus 190 Charakteren aus unzähligen Serien, darunter jene, die direkt aus den klassischen Capcom-Genres der 90er stammen, sowie ganz neue Kreationen von Fans.
Sie können Charaktere von Klassikern wie Batman oder Captain America sowie weniger bekannte Helden wie Lobo, Spawn oder Rorschach von Watchmen steuern. Diese nahezu endlose Vielfalt gilt auch für andere Aspekte des Spiels, da sie 92 verschiedene Einstellungen und praktisch alle Spielmodi enthält, die in MUGEN implementiert werden können.
Es gibt viele Spiele wie dieses, aber im Falle von SuperHeroes 2000 ist es ein Dream-Team. Dies ist ein riesiges Spiel, das sich nicht darauf konzentriert, Charaktere ohne Reim oder Grund hinzuzufügen, sondern jedes in seiner besten Form als von den Benutzern geschaffen zu wählen und dann mit jeder Version zu verbessern.